五、兵变蒙冤（1/2）
天启五年，上海。
宁远城修筑完毕后，徐光启功成身退，朝廷擢升他为礼部右侍郎兼侍读学士，他本就有归隐之意，加之看不惯朝政被魏忠贤等奸邪之人把持，便不肯就任，阉党趁机谗劾攻击，倒正合他意，次年便去职还乡。
故乡冷清，却少了京城中的钩心斗角、尔虞我诈。他已是花甲之年，再也没有多余时光挥霍，此番返乡正好可以潜心研制飞行器。自从在宁远意外制得轻气后，他将绿矾油与铁反复混合试验，不断尝试不同浓度和材料配比并改变反应条件，逐渐摸索出了生成轻气效率最高的配方和方法。他将绿矾油与铁大致按二比一的重量比例混合，其中铁块磨成铁粉，同时在装着绿矾油与铁粉的瓷缸下点火加热，如此便能最快最多地制备轻气。
另一边，孙元化经人举荐，从军辽东，辅佐名将袁崇焕驻守宁远。袁崇焕对其赏识有加，誉之“识慧两精”，孙元化感念知遇之恩，对城防之事越发尽心竭力。
天启六年正月，努尔哈赤率数万大军进逼宁远。袁崇焕早有准备，将城外百姓迁入城中，坚壁清野。努尔哈赤一生纵横沙场，未尝败绩，又怎会将小小的宁远城放在眼里？虽补给不利，却不以为意，仍率大军围攻宁远城。城内袁崇焕针锋相对，写下血书，誓与宁远共存亡。守城明军在他的指挥下，依据城池，以红夷大炮和自制重炮猛轰金军，宁远城下瞬间化为修罗地狱，炮声轰鸣，地动山摇，巨炮所指之处，金军血肉横飞，如刈麦般成片倒下。
努尔哈赤连攻两日，但宁远城犹如铜墙铁壁，巍然屹立，攻城大军却死伤惨重。战况大出努尔哈赤意料之外，自己一世英名难道要毁于这偏远小城？心急如焚之下，他孤注一掷，亲率大军发起了疯狂的猛攻。城内守军压力陡增，攻城金军状若疯虎，顶着炮火，踩着同伴的尸体攀上城墙，大部分被守军扔下的滚石击落，摔成肉饼，但也有少数人爬上城墙，一时间便如虎入羊群，所向披靡。随着攀上城墙的金兵越来越多，守军渐渐不支，炮火也弱了下来，此刻已到生死存亡之际，袁崇焕大喝一声：“亲兵营，随我上！”手提宝剑冲上城楼。两军在城墙上杀作一团，袁崇焕指挥亲兵拼死护住炮台，不断轰击拥上的金兵，但连番交战下，大炮早已不堪重负，不时便有炮管炸裂，化为废铁。眼看就要支撑不住，袁崇焕远远望见，有一金军头领，身穿玄黄盔甲，脚跨高头大马立于中军之中，显是金军尊贵之人。袁崇焕当机立断，率亲兵拼死夺回一门最大的红夷大炮，亲自操炮，瞄准那头领，一声巨响后，那人应声坠马。
很快，金军出现了一阵**，片刻之后，便如潮水般退走了。
袁崇焕守住了城池，后来他才知道，那日被他轰下马的便是敌酋努尔哈赤。努尔哈赤席卷辽东，最终却倒在了宁远城下，自此便郁结于心，数月后伤势加重，死于盛京。
宁远大捷，举国欢腾，连皇帝都下旨称赞道：“此七八年来所绝无，深足为封疆吐气！”虽事后魏忠贤拉拢不成，向皇帝进谗，袁崇焕被迫隐退，孙元化也被罢官，但经此一役，孙元化可谓名满天下，人人皆知袁督师听从他的建议，使用他铸造引进的火炮才取得了这场大胜。
崇祯元年，袁崇焕复出，点名要孙元化襄赞辽省军务。崇祯三年，朝廷诛杀袁崇焕，一时间军中无将，人心惶惶。为稳人心，朝廷决定启用孙元化，三月，加山东按察副使，五月升任登、莱二州巡抚。上任后，孙元化召集传教士，大胆募用西洋人士，帮助制造火炮，操练兵士。在他治下，登州西学人才云集，发展成为全国火炮研制的中心。
徐光启此时已奉旨回京，升任礼部尚书。看到爱徒终于不负平生所学，一展抱负，他大感欣慰。但袁崇焕之死可疑之处甚多，徐光启见多了官场风云变幻，互相倾轧，便提醒孙元化木秀于林，风必摧之，让他务必低调行事。袁崇焕被杀惨状，历历在目，孙元化不禁惶然，又想到自己今日成就，皆源于恩师悉心教导，便欣然应允，却不知一场大祸正悄悄降临。
袁崇焕被杀，罪名之一便是擅杀平辽总兵官毛文龙。袁崇焕死后，毛文龙部下孔有德、耿仲明、李九成、李应元等人无人能制，日益骄横。孙元化素来认为以辽人守辽土、以辽土养辽人之策颇有道理，便不计前嫌，收留了他们。孙元化身边幕僚对此多有疑虑，直言孔有德等人目无法纪，唯利是图，恐难控制，但孙元化不以为意，不仅在兵马粮饷上处处给予优待，还为其部装备精锐火器。
崇祯四年，大凌河城遭围，孙元化令孔有德率八百骑兵赶赴前线支援。行至吴桥，雨雪交加，山东民风彪悍，当地百姓对孙元化优待辽东官兵早已心存不满，皆闭门罢市，以致部队补给困难。孔有德部匪性不改，强夺物资，谁知抢的竟是当地望族的家仆，孔有德欺软怕硬，将犯事士兵穿箭游营，不料其他士兵愤而报复，杀死那家仆，家仆主人亦非善类，纠缠不休，要求彻查。孔有德正犹豫不决，奉命购买马匹的李九成因将钱财挪用，害怕孙元化责罚，便怂恿孔有德叛乱。见事态越闹越大，孔有德与李九成一拍即合，索性不一做二不休，引兵造反，连陷临邑、陵县、商河、青城诸城，直扑登州。
孙元化万万没想到呕心沥血打造的火器部队竟将矛头指向了自己，阵脚大乱，匆忙派兵驻防。崇祯五年一月，孔有德兵临城下，守城部队中的辽东士兵旋即倒戈，引叛军入城。城内山东士兵因孙元化厚此薄彼，斗志全无，顷刻间便土崩瓦解。孙元化无兵无将，唯有招募的二十余名西洋火炮教练不离不弃，随他拼死抵抗，终归势单力薄，无力回天。孙元化自杀不成，为叛军所擒。
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